生命科學(xué)中是否存在類似支付二維碼一樣的二進制規(guī)律密碼?中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院裴端卿課題組通過研究干細(xì)胞誘導(dǎo)過程,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞在發(fā)生“返老還童”時,染色質(zhì)的“開—關(guān)”狀態(tài)恰似二維碼一樣記錄了這個過程的大量信息。通過破譯這些“二維碼”的內(nèi)在含義,他們闡述了干細(xì)胞誘導(dǎo)過程的變化機制。該研究成果于近日發(fā)表在《細(xì)胞·干細(xì)胞》上。
成纖維細(xì)胞在導(dǎo)入誘導(dǎo)因子后,會啟動一套奇妙的未知程序,將體細(xì)胞返老還童到受精后約3.5天的狀態(tài)。這種將體細(xì)胞誘導(dǎo)為多能干細(xì)胞是探索細(xì)胞命運轉(zhuǎn)變機理的理想體系。過去10年來,全世界的科學(xué)家都在研究此奇妙過程,但在深層機制研究中并沒有抽象出具有普遍性邏輯或者規(guī)律。
“形象地說,DNA就像一本百科全書,每個細(xì)胞都攜帶著能形成個體的所有信息,但在某個特定階段,只能翻開這本書里面的一部分。我們的工作就是記錄從體細(xì)胞到多能干細(xì)胞過程中,打開這本書的方式,以及研究是什么‘手’在翻書。”論文第一作者李東偉博士說。他們通過使用ATAC-seq技術(shù)去讀取染色質(zhì)“開—關(guān)”狀態(tài)的“二維碼”,發(fā)現(xiàn)在多能性獲得和細(xì)胞命運轉(zhuǎn)變過程中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)具備由從開放到關(guān)閉(OC)和關(guān)閉到開放(CO)間的二元變化規(guī)律,且“二維碼”在整個干細(xì)胞誘導(dǎo)過程中一直在變化。
裴端卿介紹,研究團隊通過檢測細(xì)胞命運轉(zhuǎn)變過程中染色質(zhì)開關(guān)的動態(tài)變化模式,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞“返老還童“過程伴隨著大規(guī)模染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重排,首先會關(guān)閉體細(xì)胞特異性位點,同時逐漸打開多能性相關(guān)位點;在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重排的進程中,發(fā)現(xiàn)Sap30作為一個重編程過程被激活的重要因子,會通過促進去乙酰化修飾來抑制體細(xì)胞關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,進而促進細(xì)胞命運向多能性方向轉(zhuǎn)變。這部分研究結(jié)果首次揭示了體細(xì)胞重編程過程中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)動態(tài)變化的規(guī)律,并為理解體細(xì)胞重編和其他相關(guān)細(xì)胞命運轉(zhuǎn)變提供了新的參考理論模型。